עובד אשר תרם סכום של מעל ל-190 שקלים בשנה לגוף ציבורי אשר מחזיק באישור לפי סעיף 46, זכאי לקבל הטבת מס בשווי 35 אחוזים מסך התרומה, כזיכוי ממס הכנסה באותה שנת המס. עובד אשר מעוניין לקבל את ההטבה לאחר סיומה של שנת המס בה הוא העביר את התרומה, יכול להגיש בקשת החזר מס על תרומות. על המוסד הציבורי אליו תועבר התרומה להיות ללא מטרות רווח, כאשר לרוב מדובר על עמותות או חברות לתועלת הציבור. לרוב, גופים מסוג אלו יתגאו בכך שהם קיבלו את האישור לפי סעיף 46, מכיוון שבצורה הזו גיוס הכספים הופך לנוח יותר, מעצם קיומו של האישור.

ניתן לקבל את ההטבה גם אם העברתם מספר תרומות למספר גופים שונים המחזיקים באישור לפי סעיף 46, כל עוד סך התרומה עלה על 190 שקלים בשנת המס. הסכום המקסימלי, אגב, שבגינו ניתן לקבל את הזיכוי האמור הוא 9,517,000 שקלים, נכון לשנת 2022, או לחילופין 30 אחוז מההכנסה החייבת במס של התורמים באותה שנת המס, לפי הנמוך שבין השניים.